DNA microarray (također poznat i kao obično DNA čip ili biočip) je skup mikroskopski DNA mjesta vežu na čvrstu površinu. Znanstvenici koriste DNA microarrays za mjerenje oblika ekspresije velikog broja gena istovremeno ili za genotipizaciju više regija genoma. Svaka tačka DNA sadrži pikomole (10 molova) specifične DNA konkatenacije, poznate kao sonde (ili izvještači ili oligosi). To mogu biti kratki odjeljak gena ili drugi DNA element koji se koristi za hibridizaciju uzorka cDNA ili cRNA (koja se također naziva anti-sense RNA) u uzorku pod visokim strogostima. Cilja sonde hybridization uobičajeno se otkriva i kvantificira otkrivanjem ciljeva označenih fluoroforom, srebrom ili hemiluminiscencijom radi određivanja relativnog obilja slijeda nukleinskih kiselina u cilju. Izvorni nizovi nukleinskih kiselina bili su makro nizovi od približno 9 cm × 12 cm, a prvo računalno ispitivanje na temelju slika objavljeno je 1981. godine. Izumio ga je Patrick O. Brown.
Slika 143A | Sažetak DNA mikroračuna. Unutar organizama se geni prepisuju i spajaju čime se dobivaju zreli transkripti mRNA (crveni). MRNA se ekstrahira iz organizma, a reverzna transkriptaza se koristi za kopiranje mRNA u stabilnu ds-cDNA (plava). U microarrays, ds-cDNA je fragmentirana i fluorescentno označena (narančasta). Označeni fragmenti se vežu na uređeni niz komplementarnih oligonukleotida, a mjerenje fluorescentnog intenziteta u nizu ukazuje na obilje unaprijed određenog niza sekvenci. Ti su nizovi obično odabrani posebno za izvještavanje o zanimljivim genima unutar genoma organizma. | Thomas Shafee / CC BY (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/legalcode) | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Summary_of_RNA_Microarray.svg) iz Wikimedia Commons
Autor : Milos Pawlowski
Primjedbe
Objavi komentar