Interbonski RNA spektakularni ispitivanje distanciranog spacera (RISK) Ribosomal RNA (rRNA) je akcija ispitivanja mikrobiološke zajednice koja pruža način uspoređivanja različitih utjecaja u okruženju ili utjecaju liječenja bez pristranosti koje nameću pristupi ovisni o kulturi. Ova vrsta pregleda često se naziva otiskom prsta u zajednici. RISA uključuje PCR amplifikaciju regiona gena rRNA između malog (16S) i velikog (23S) podjedinica nazvanog intergenirano razmaknuće regije ISR.
Korištenjem oligonukleotidnih klica namijenjenih konzerviranim regijama u genima 16S i 23S, RISA fragmenti mogu se stvoriti iz većine dominantnih bakterija u uzorku okoliša. S druge strane, većina rRNA operona služi strukturnim uslugama, dijelovi intergenijskog područja 16S-23S mogu kodirati tRNA ovisno o bakterijskoj vrsti. Međutim, taksonomska vrijednost ISR nalazi se u značajnoj heterogenosti i u duljini i ujedinjavanju nukleotida. U RISA-i pokušavamo iskoristiti dužinsku heterogenost ISR-a, za koju se pokazalo da se kreće između 150 i 1500 bp, pri čemu je većina duljina ISR-a između 150 i 500 bp.
Slika 250A | Opći obrnuti northern blot postupak korištenjem cDNA iz uzorka testera i SSH knjižnice. Prekomjerna ekspresija transkripata u uzorku testera pojavit će se kao tamnije točkice na membrani | Cddouglas2 / Attribution-Share Alike 4.0 International | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Revnorthern1.jpg) from Wikimedia Commons
Autor : Yavor Mendel
Primjedbe
Objavi komentar