Masivno paralelno sekvenciranje potpisa (MPSS)

Prvo od visokopropusnih tehnologija sekvenciranja, masovno paralelno sekvenciranje potpisa (ili MPSS), razvijen je 1990-ih u Lynx Therapeutics, tvrtki koju su 1992. osnovali Sydney Brenner i Sam Eletr. MPSS je bio operacija koja se temelji na zrncu i koja je koristila complex pri ruci ligacije adaptera, nakon čega slijedi dekodiranje adaptera, iščitavanje konkatanacije u koracima od četiri nukleotida. Ova operacija učinila ju je osjetljivom na pristranost specifična za sekvencu ili gubitak određenih sekvenci. Na osnovu toga što je tehnologija bila tako complex, MPSS je izvodio samo "interno" tvrtka Lynx Therapeutics, a ne DNA Strojevi za sekvenciranje prodani su neovisnim laboratorijima. Lynx Therapeutics spojio se sa Solexa (kasnije je stekao Illumina) 2004. godine, što je dovelo do razvoja sekvenciranja po sintezi, jednostavnijeg priručnika Manteia prediktivne medicine, zbog čega je MPSS zastario. Bilo kako bilo, bitna svojstva izlaza MPSS bila su tipična za kasnije visokopojasne tipove podataka, uključujući stotine tisuća kratkih DNA sekvenci. U slučaju MPSS-a, oni se obično koriste za sekvenciranje cDNA za mjerenje nivoa gena ekspresije.

Slika 151A | Na temelju njihovih područja koja se preklapaju, moraju se sastaviti višestruko fragmentirane analize pridruživanja. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) iz Wikimedia Commons

Slika 151A | Na temelju njihovih područja koja se preklapaju, moraju se sastaviti višestruko fragmentirane analize pridruživanja. | Suspencewl / CC0 | Page URL : (https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Mapping_Reads.png) iz Wikimedia Commons

Autor : Milos Pawlowski

Reference:

Tehnike molekularne biologije I

Alati molekularne biologije II

Primjedbe